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Portail Offres Offre UMR8227-JERCOC-012 - Ingénieur d'études en Génomique comparative des macroalgues brunes (H/F)Ingénieur d'études en Génomique comparative des macroalgues brunes (H/F)Date Limite Candidature : lundi 2 décembre 2024 23:59:00 heure de ParisAssurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler.Informations généralesIntitulé de l'offre : Ingénieur d'études en Génomique comparative des macroalgues brunes (H/F)Référence : UMR8227-JERCOC-012Nombre de Postes : 1Lieu de travail : Date de publication : vendredi 8 novembre 2024Type de contrat : CDD Technique/AdministratifDurée du contrat : 6 moisDate d'embauche prévue : 1 janvier 2025Quotité de travail : Temps completRémunération : entre 2 466,98€ et 3 676,14€ selon expérienceNiveau d'études souhaité : Niveau 6 - (Bac+3 ou 4)Expérience souhaitée : IndifférentBAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnementEmploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de donnéesMissionsLes algues brunes restent encore mal caractérisées à l’échelle génomique par rapport à d'autres groupes eucaryotes majeurs tels que les plantes terrestres et les animaux. Pour en savoir plus sur la biologie de ce groupe d’organismes, la Station Biologique de Roscoff, en collaboration avec Genoscope et un consortium international, a réalisé un projet visant à générer des séquences génomiques complètes pour 40 espèces d’algues brunes et quatre groupes frères (https://phaeoexplorer.sb-roscoff.fr/home/). Les génomes sont désormais assemblés et annotés et les premiers réseaux métaboliques à l’échelle des génomes sont en cours d’élaboration.Le candidat(e) sera impliqué(e) dans l'analyse des séquences génomiques, en utilisant des approches de génomique comparative pour caractériser les familles de gènes (notamment associées aux caractéristiques biologiques clés des algues brunes), reconstruire des arbres des espèces à l’échelle des génomes et caractériser les mécanismes d’évolution à l’échelle des réseaux métaboliques.Activités- Traiter les analyses phylogénétiques et évolutives de familles de gènes- Reconstruire des arbres phylogénétiques.- Utiliser des approches de génomique comparative.- Analyser des réseaux métaboliques.- Interpréter et mettre en forme (publication) des résultats obtenus.CompétencesSavoir faire :- Traiter des données.- Interagir avec des biologistes et des informaticiens.- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats.- Avoir des qualités rédactionnelles.- Transmettre des connaissances.- Utiliser les techniques de présentation.- Avoir des connaissances générales de l'annotation du génome eucaryote et phylogénie moléculaire, en génétique et biologie moléculaire, en analyse statistique et de programmation.Savoir être :- Sens relationnel.- Sens de l'organisation.- Être rigoureux, créatif et autonome.Contexte de travailLa Station Biologique de Roscoff (SBR), dont l'UMR8227 fait partie, est un centre de recherche en biologie marine et océanologie (http://www.sb-roscoff.fr/about-roscoff-marine-station/missions.html). Elle est située dans la ville de Roscoff sur la côte nord de la Bretagne, à environ 60 km à l'est de Brest. La SBR comprend environ 200 personnels permanents.ABiMS (http://abims.sb-roscoff.fr/) est une plateforme de bioinformatique travaillant en étroite collaboration avec plusieurs groupes de recherche au sein de la SBR. Elle fournit à la fois son expertise en analyse de données et développements, des outils et une infrastructure informatique performante permettant d'assurer un contexte efficace pour une recherche intégrée. La personne recrutée travaillera au sein de la plateforme ABiMS.Le poste inclura des interactions fortes avec l'équipe Dynamique et Organisation des Génomes de l'ENS Paris (pour la partie génomique comparative) et l'équipe Dyliss de IRISA à Rennes (pour la partie réseaux métaboliques) qui pourraient impliquer des déplacements.Contraintes et risquesPas de contrainte ni de risque spécifique. #J-18808-Ljbffr